2005年11月,江西三清山、山西五台山、云南大理和中国南方喀斯特等四项自然遗产申报地进入最后竞争,争夺中国2006年唯一的一个申报提名。2005年12月30日,国家建设部正式决定:2006年中国申报的世界自然遗产提名是中国南方喀斯特。2006年1月13日,经国务院签署文件后,“中国南方喀斯特”申报材料由中国教科文组织全委会正式呈报联合国教科文组织世界遗产委员会。
目前,世界遗产中心已正式回信告之:“中国南方喀斯特”申报材料完全符合世界遗产中心对世界遗产申报的技术要求。